När påve Honorius II 1130 dog, nominerades två kandidater som konkurrerade om påveämbetet – Anacletus II och Innocentius II. Det föll på Bernhards lott att fastställa pretendenternas värdighet, och avgöra vilken kandidat som var lämpligast. Efter moget övervägande, bestämde han sig för Innocentius II som levde i landsflykt i Frankrike. Med sitt vänliga sätt, lyckades Bernhard övertala Frankrikes, Englands, Spaniens och Tysklands makthavare att acceptera Innocentius II som påve. Slutligen var även kejsaren i Italien övertygad och Anacletus II fördrevs från Rom.